Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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