Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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