Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FSCN1Q16658 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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