Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms