Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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