Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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