Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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