Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SS18Q15532 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SS18Q15532 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SS18Q15532 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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