Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms