Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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