Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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