Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
R3HDM1Q15032 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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