Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms