Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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