Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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