Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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