Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL2Q13617 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL2Q13617 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms