Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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