Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms