Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCOF1Q13428 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCOF1Q13428 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCOF1Q13428 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCOF1Q13428 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCOF1Q13428 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TCOF1Q13428 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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