Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRSQ13332 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRSQ13332 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms