Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME3Q13232 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms