Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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