Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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