Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GPS1Q13098 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GPS1Q13098 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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