Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms