Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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