Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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