Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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