Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms