Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms