Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ST3GAL4Q11206 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ST3GAL4Q11206 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms