Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms