Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms