Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms