Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms