Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP1-1Q07627 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms