Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX1T1Q06455 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms