Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms