Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID5AQ03989 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms