Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms