Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms