Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms