Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms