Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms