Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms