Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms