Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMF1P82094 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMF1P82094 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMF1P82094 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms