Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms