Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms